医院重视科研工作，近三年获省、厅级以上科研成果奖20项，承担各类科研项目86项，其中国家自然科学基金7项，国外合作项目1项、省自然科学基金9项、省国际合作项目3项、昆明医学院创新群体基金1项、中国博士后科学基金1项、吴阶平医学基金1项、云南省科技厅基础处重点项目1项、昆明市科技局计划项目2项、云南省教育厅基金57项、昆明医学院“十一五”教改立项项目3项。